Pros and cons of traditional dPCR and real-time dPCR

[English]

 Digital PCR (dPCR) is a powerful technology with several advantages over traditional PCR, but like any technology, it also has its limitations. Some of the limitations of dPCR include:

Cost: dPCR instruments and reagents can be more expensive than traditional PCR equipment and reagents, making it less accessible for some researchers.

Sample size: dPCR requires a larger sample size than traditional PCR, which can be a limitation when working with limited or precious samples.

Complexity: dPCR can be more technically challenging than traditional PCR, requiring specialized training and experience to perform and interpret results.

Droplet stability: For droplet-based dPCR systems, the stability of the droplets can be a concern. Droplets can merge or evaporate over time, which can impact the accuracy of the results.

Sensitivity: Although dPCR is highly sensitive, it may not be as sensitive as other technologies, such as quantitative PCR (qPCR), for some applications.

False positives: dPCR can generate false positive results, particularly when working with complex samples that contain inhibitory substances or contaminants.

Despite these limitations, dPCR has become a valuable tool for many researchers due to its high accuracy and robustness for quantifying specific targets in a sample. In many cases, the benefits of dPCR outweigh the limitations, making it a valuable technology for a wide range of applications.

Real-time digital PCR (dPCR) can overcome some of the limitations of traditional dPCR, but it also has its own set of limitations.

Advantages of real-time dPCR include:

Improved accuracy: Real-time dPCR provides more accurate results by continuously monitoring the amplification of target DNA in each droplet, and avoiding any potential problems with droplet stability.

Lower cost: Real-time dPCR systems can be less expensive than traditional dPCR systems, as they do not require the use of specialized instruments for droplet formation and analysis.

Increased sensitivity: Real-time dPCR can be more sensitive than traditional dPCR, as it provides a continuous measurement of the target DNA throughout the amplification process.

However, real-time dPCR also has some limitations, including:

Complexity: Real-time dPCR can still be a technically challenging procedure, requiring specialized training and experience to perform and interpret results.

Sample size: Real-time dPCR still requires a larger sample size than traditional PCR, which can be a limitation when working with limited or precious samples.

False positives: Real-time dPCR can still generate false positive results, particularly when working with complex samples that contain inhibitory substances or contaminants.

In conclusion, real-time dPCR offers many benefits over traditional dPCR, but it is still a complex technology with limitations. It is important to carefully consider the specific needs and limitations of your project when deciding whether to use real-time dPCR or another technology

[한국어]

디지털 PCR(dPCR)은 기존 PCR에 비해 몇 가지 장점이 있는 강력한 기술이지만, 모든 기술이 그렇듯 한계도 있습니다. dPCR의 몇 가지 한계는 다음과 같습니다:

비용: dPCR 기기 및 시약은 기존 PCR 장비 및 시약보다 비쌀 수 있으므로 일부 연구자들은 접근성이 떨어질 수 있습니다.

샘플 크기: dPCR은 기존 PCR보다 더 큰 샘플 크기가 필요하며, 이는 제한적이거나 귀중한 샘플로 작업할 때 제한이 될 수 있습니다.

복잡성: dPCR은 기존 PCR보다 기술적으로 더 까다로울 수 있으며, 결과를 수행하고 해석하는 데 전문적인 교육과 경험이 필요합니다.

드롭렛 안정성: 드롭렛 기반 dPCR 시스템의 경우, 드롭렛의 안정성이 문제가 될 수 있습니다. 시간이 지남에 따라 액적이 합쳐지거나 증발할 수 있으며, 이는 결과의 정확성에 영향을 미칠 수 있습니다.

민감도: dPCR은 민감도가 높지만 일부 애플리케이션의 경우 정량적 PCR(qPCR)과 같은 다른 기술만큼 민감하지 않을 수 있습니다.

위양성: 특히 억제 물질이나 오염 물질이 포함된 복잡한 샘플로 작업할 때 dPCR은 위양성 결과를 생성할 수 있습니다.

이러한 한계에도 불구하고, 샘플에서 특정 표적을 정량화할 수 있는 높은 정확도와 견고성 덕분에 많은 연구자에게 유용한 도구로 자리 잡았습니다. 많은 경우, dPCR의 이점이 한계보다 더 크기 때문에 다양한 응용 분야에 유용한 기술입니다.

실시간 디지털 PCR(dPCR)은 기존 dPCR의 일부 한계를 극복할 수 있지만, 그 자체의 한계도 있습니다.

실시간 dPCR의 장점은 다음과 같습니다:

정확도 향상: 실시간 dPCR은 각 방울에서 표적 DNA의 증폭을 지속적으로 모니터링하고 방울 안정성에 대한 잠재적인 문제를 방지하여 보다 정확한 결과를 제공합니다.

비용 절감: 실시간 dPCR 시스템은 액적 형성 및 분석을 위한 특수 기기를 사용할 필요가 없으므로 기존 dPCR 시스템보다 저렴할 수 있습니다.

감도 증가: 실시간 dPCR은 증폭 과정 내내 표적 DNA를 지속적으로 측정하기 때문에 기존 dPCR보다 더 민감할 수 있습니다.

그러나 실시간 dPCR에는 다음과 같은 몇 가지 제한 사항도 있습니다:

복잡성: 실시간 dPCR은 여전히 기술적으로 까다로운 절차이며, 수행 및 결과 해석을 위해 전문 교육과 경험이 필요합니다.

샘플 크기: 실시간 dPCR은 여전히 기존 PCR보다 더 큰 샘플 크기가 필요하며, 이는 제한적이거나 귀중한 샘플로 작업할 때 제한이 될 수 있습니다.

위양성: 특히 억제 물질이나 오염 물질이 포함된 복잡한 샘플로 작업할 때 실시간 dPCR은 여전히 위양성 결과를 생성할 수 있습니다.

결론적으로, 실시간 dPCR은 기존 dPCR에 비해 많은 이점을 제공하지만 여전히 한계가 있는 복잡한 기술입니다. 실시간 dPCR을 사용할지 다른 기술을 사용할지 결정할 때는 프로젝트의 특정 요구 사항과 한계를 신중하게 고려하는 것이 중요합니다.